#日本新冠病毒已變異
從歐洲株改變了六個鹼基，從東京向全國擴散
最近我不斷被問這個問題。聽說日本的新冠病毒變種了？是以很恐慌的口氣問我的。
結論先寫在前面，#新冠病毒變異不是新聞。我甚至覺得是好消息，因為這在日本流行的第二波，似乎致病性有變弱。不過還不到確切下此結論的時候。
這是日本國立感染症研究所在8月5日發表的研究報告。發現如下：
1.研究人員分析了7月16日之前日本國內新冠病毒感染者3618人，鑽石公主號的感染者70人，機場檢疫所確認的感染者67人的病毒基因組序列，並和全球約4.6萬名新冠病毒感染者的病毒基因組序列進行了比對。
2.日本最早是中國武漢的境外移入株，三四月第一波大流行時是歐洲株同時在日本國內多處發生，此病毒株在五月已經平息。
3.目前在日本國內流行的新冠病毒毒株是比歐洲株發生了6個鹼基變異，中間花了三個月的時間。此病毒株可能從6月下旬開始從東京向日本全國擴散。不過日本全國的病毒基因序列尚未完全分析完，報告還有修正的可能。
4.新冠病毒的變異速度，世界上的資料庫看起來是一年會產生24.1個鹼基變異。日本觀察到也差不多，到目前七個月左右是產生了15個鹼基的變異，平均一個月2個。
5.報告最後提醒，#關於新型冠狀病毒鹼基突變是否會引起病毒致病性的變化常引起爭議。一般來說，病毒演化方向會傾向於降低致病性，適應物種良好，潛伏的病毒種。但新冠的致病性不能只看基因的變化，要根據患者的臨床表現，個別病毒株的細胞生物學，感染實驗等做綜合的判斷。
#04b醫師解讀：
1.新冠病毒是RNA病毒，比較容易在複製時出錯而產生變異，這不是新聞。從二月到現在世界各地，包括我們的中研院已經發表多次新冠病毒的變異研究結果。
2.比較有意義的是，這個變異會不會造成致病性的改變？會不會影響病毒偵測？會不會造成研發疫苗或是藥物的阻礙？
3.致病性來說，以適者生存的觀點來想，長期來看傳染力越高，越適應人類，致病性較低，多半人得了無症狀或輕症的病毒，會長存於人類社會。如果得了多半重症住院，這個病毒株就被隔離而阻斷其傳播，通常不會繼續傳下去。因此我個人會判斷新冠病毒有機會會越變異越弱的。從東京第一波和第二波疫情看來，其重症比例和死亡人數的確似乎有滿大的差別。看檯面確診人數第二波多很多，但整個七月東京確診超過7000人，卻只有20多人重症，4月時最多則有105人重症。這不能只單獨用多半是年輕人感染解釋，因為感染已經擴展到年長的族群了。
但這當然還需要繼續小心觀察下去，因為第二波的疫情還在進行之中。
4.至於病毒偵測，研發疫苗或藥物的阻礙，主要就是看這個變異會不會大到影響到其作用標的。
#黃立民老師曾言：
病毒變異的位置如果變到PCR偵測的序列，那這個PCR就會測不出來。目前全世界都很即時的追蹤病毒的序列，這可以很快的修正。
病毒變異如果是對疫苗針對的位置變異，這就會影響到疫苗的開發，疫苗就需要改變。
目前最有效的藥物（指瑞得西韋）是針對酵素，這個酵素比較不容易變異。
#李秉穎老師曾言：
冠狀病毒是RNA病毒，雖然是不穩定容易突變，但突變不是關鍵位置，所以不至於和流感一樣經由突變到大家都不認識他。冠狀病毒從動物病毒突變成人類病毒已經是他的極限了。
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